Nature綜述| 癌癥中DNA甲基化的分析：換個(gè)角度審視

高分文章|LC-MS+m6A-seq

周四有課|消化系統(tǒng)疾病多組學(xué)聯(lián)合分析交流會(huì)

lncRNA的機(jī)制研究相當(dāng)困難，主要實(shí)驗(yàn)過程復(fù)雜，實(shí)驗(yàn)量巨大，如果想發(fā)超10分的高分文章并且有好的研究思路可以從這個(gè)角度探索。其實(shí)我們可以換個(gè)角度研究lncRNA，不要將lncRNA作為一個(gè)調(diào)節(jié)分子；而是把lncRNA當(dāng)做和mRNA一樣的分子來研究。在體外，可以通過分子干擾手段，進(jìn)行分子及表型研究；在體內(nèi)，也是如此。兩者通過各種組合，也能輕松get一篇5分以上的文章。

類風(fēng)濕性關(guān)節(jié)炎(RA)的診斷主要基于臨床癥狀和類風(fēng)濕因子(RF)，抗瓜氨酸肽抗體(抗CCP)的血清學(xué)陽性，而銀屑病關(guān)節(jié)炎(PsA)只有臨床和影像學(xué)特征有助于診斷。雖然大多數(shù)RA患者RF，抗CCP血清陽性，但約15%-20%的RA病例中，血清中RF和抗CCP水平并未升高，由于血清陰性RA(negRA)和PsA的癥狀非常相似，且沒有可靠的臨床標(biāo)志物，因此 ,兩者的鑒別診斷十分困難。

我們以前熟悉的研究，往往從轉(zhuǎn)錄組起始，測得轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)后，尋找差異表達(dá)顯著的基因。然后，分別有生物標(biāo)志物方向和機(jī)制研究方向，兩種套路成文。蛋白組學(xué)也有類似的套路。今天，招財(cái)貓講述的文章是機(jī)制研究方向的。我們來看下吧！

環(huán)狀RNA (circRNAs)是共價(jià)封閉的長鏈非編碼RNA，在多種細(xì)胞活動(dòng)和多種人類疾病中具有重要作用。在雙鏈DNA病毒(dsDNA)中已經(jīng)發(fā)現(xiàn)了幾種與癌癥相關(guān)的病毒circRNA。研究人員通過計(jì)算預(yù)測來自病毒感染相關(guān)RNA測序數(shù)據(jù)的病毒circRNA，對23個(gè)病毒物種的11924個(gè)circRNA進(jìn)行了系統(tǒng)調(diào)查。除了dsDNA病毒外，研究還揭示了單鏈RNA病毒和逆轉(zhuǎn)錄病毒中的大量circRNA，如寨卡病毒、甲型流感病毒、扎伊爾埃博拉病毒和人類免疫缺陷病毒。

近年來，非編碼RNA（ncRNA）調(diào)控一直是生物學(xué)研究，特別是疾病研究的熱點(diǎn)；包括miRNA、rRNA、tRNA、lncRNA和circRNA等多種未知功能的RNA。大部分的環(huán)狀RNA是由外顯子序列構(gòu)成，在不同的物種中具有保守性，同時(shí)存在組織及不同發(fā)育階段的表達(dá)特異性。由于circRNA對核酸酶不敏感，所以比線性RNA更為穩(wěn)定，這使得circRNA在作為新型臨床診斷標(biāo)記物的開發(fā)應(yīng)用上具有明顯優(yōu)勢，今天就與大家分享幾篇circRNA領(lǐng)域的新研究。

轉(zhuǎn)眼5月就要過去啦，小編在這里為大家精心上收集了以DNA甲基化研究為主題的新研究成果，截止現(xiàn)在，5月以DNA methylation為關(guān)鍵詞檢索到的文獻(xiàn)一共有353篇，小編在這里為大家精心挑選一下7篇作為重點(diǎn)分享，包括EWAS、腫瘤標(biāo)志物研究、環(huán)境污染對DNA甲基化的影響以及一些容易模仿的純分析文章等。在文末附表中列出更多DNA甲基化研究的文獻(xiàn)和高分綜述的研究方向、登刊時(shí)間、技術(shù)平臺(tái)和摘要等信息，讓您不用再費(fèi)時(shí)費(fèi)力搜索，就能輕松獲取5月新的DNA甲基化研究成果和動(dòng)態(tài)，平均IF＞8。

越來越多的證據(jù)表明，阿爾茨海默氏病(AD)是一種普遍的代謝性疾病，發(fā)病機(jī)理涉及多種生化途徑的失調(diào)。目前對AD的治療方法為抗淀粉樣β(Aβ)蛋白療法,但是該方法治愈率低。所以確定AD發(fā)病機(jī)制的新靶點(diǎn)對于開發(fā)有效的治療方法至關(guān)重要。