重點(diǎn)產(chǎn)品一:Illumina 850K 芯片優(yōu)惠來襲(低至 3500¥/ 樣本)
針對(duì)人類樣本,單堿基分辨率,低樣本門檻,高焦磷酸平臺(tái)驗(yàn)證率
活動(dòng)說明
2019 年 3 月 11 日~5 月 11 日期間,前 200 張芯片可享受優(yōu)惠的促銷價(jià)格,同時(shí)還可贈(zèng)送高級(jí)分析(任選三項(xiàng),需滿足單項(xiàng)分析限定的樣本需求,20 個(gè)樣本以內(nèi))。
伯豪優(yōu)勢(shì)
1、高分文章經(jīng)驗(yàn)豐富:
伯豪生物擁有多年的甲基化芯片服務(wù)經(jīng)驗(yàn),服務(wù)客戶曾發(fā)表多篇 IF>10 文章,包括 JCO, Nature Communications, Cell Stem Cell 等;
2、強(qiáng)大的數(shù)據(jù)分析團(tuán)隊(duì):
伯豪生物擁有一支具有豐富生物信息分析經(jīng)驗(yàn)的工程師隊(duì)伍,人才梯隊(duì)配置合理,具有大項(xiàng)目分析經(jīng)驗(yàn)(EWAS 項(xiàng)目),能完成各類高難度高級(jí)分析;
3、快的分析周期:
芯片上機(jī)結(jié)束,拿到數(shù)據(jù)后,2 個(gè)工作日即可完成基礎(chǔ)分析;
4、低樣本起始:
針對(duì)特殊樣本(FFPE),樣本總量低至 10ng, 仍可提供完美的解決方案,詳情請(qǐng)咨詢各地銷售;
5、 大項(xiàng)目經(jīng)驗(yàn):
伯豪生物成立發(fā)展的十年間,積累了豐富的大項(xiàng)目經(jīng)驗(yàn)。
伯豪案例(近兩年經(jīng)典案例)
經(jīng)典案例一
Qiu J , Peng B , Tang Y , et al. CpG Methylation Signature Predicts Recurrence in Early-Stage Hepatocellular Carcinoma: Results From a Multicenter Study[J]. Journal of Clinical Oncology, 2017, 35(7):734-742. IF=26.303
在全世界分范圍內(nèi),每年因肝癌死亡的病例超過 50 萬人,是主要的因癌死亡病因之一。本研究建立了一種預(yù)測(cè)早期肝癌病人術(shù)后復(fù)發(fā)的模型。
經(jīng)典案例二
Ren X , Yang X , Cheng B , et al. HOPX hypermethylation promotes metastasis via activating SNAIL transcription in nasopharyngeal carcinoma[J]. Nature Communications, 2017, 8:14053. IF=12.35
在我國(guó)華南地區(qū),鼻咽癌有較高的發(fā)病率。中山大學(xué)附屬腫瘤醫(yī)院的科學(xué)工作者,采用甲基化芯片在全基因組范圍內(nèi)鑒定了鼻咽癌病人特異的轉(zhuǎn)錄因子 HOPX。該研究為鼻咽癌診斷提供了新的生物標(biāo)記,為鼻咽癌的治療提供了新的靶點(diǎn)。
重點(diǎn)產(chǎn)品二:Agilent 甲基化捕獲測(cè)序(4200¥/ 樣本,20G 原始數(shù)據(jù))
SureSelectXT 甲基化靶向序列捕獲平臺(tái)(Methyl-Seq) 是安捷 倫公司推出的全面的甲基化發(fā)現(xiàn)系統(tǒng)。該平臺(tái)為甲基化基因組區(qū)域研究提供了具有單堿基分辨率的高度可靠且高效的方法?,F(xiàn)有目錄化產(chǎn)品包括人、小鼠和大鼠甲基化測(cè)序設(shè)計(jì)。
針對(duì)人類、小鼠和大鼠樣本,單堿基分辨率,200 萬 + 位點(diǎn)檢測(cè),高焦磷酸平臺(tái)驗(yàn)證率
活動(dòng)說明
2019 年 3 月 11 日 - 5 月 11 日期間,前 100 個(gè)樣本可享受優(yōu)惠的促銷價(jià)格,同時(shí)還可贈(zèng)送高級(jí)分析(任選三項(xiàng),需滿足單項(xiàng)分析限定的樣本需求,10 個(gè)樣本以內(nèi))。
技術(shù)參數(shù)
1、人:84 Mb 設(shè)計(jì)長(zhǎng)度(370 萬 CpG 位點(diǎn));
2、小鼠:109Mb 設(shè)計(jì)長(zhǎng)度;
3、大鼠:97Mb 設(shè)計(jì)長(zhǎng)度。
伯豪優(yōu)勢(shì)
1、200 萬 +CpG 位點(diǎn)檢測(cè):
20G 原始數(shù)據(jù)可以覆蓋至少萬 200CpG 位點(diǎn),是甲基化芯片的 2.5 倍以上。
2、 連續(xù)的捕獲區(qū)段檢測(cè):
不同于芯片的位點(diǎn)設(shè)計(jì)原理,捕獲測(cè)序?qū)τ谔结槻东@區(qū)域的檢測(cè)是連續(xù)的,對(duì)于 DMR 的分析更準(zhǔn)確。
3、高技術(shù)重復(fù)性:
針對(duì)于人類樣本的設(shè)計(jì)區(qū)域與 850K 芯片有 50 萬左右的位點(diǎn)重疊,平臺(tái)之間相關(guān)性系數(shù)達(dá) 0.98。
4、 小鼠、大鼠樣本甲基化研究必選利器:
小鼠和大鼠的甲基化檢測(cè)產(chǎn)品中,并無像 850K 甲基化芯片那樣的產(chǎn)品,選用全基因甲基化測(cè)序必然要付出更大的成本代價(jià)。Agilent 平臺(tái)針對(duì)小鼠和大鼠的捕獲區(qū)域設(shè)計(jì)覆蓋了所有 UCSC 注釋的基因和 CpG 島。
文獻(xiàn)案例(經(jīng)典案例)
Yagi M , Kishigami S , Tanaka A , et al. Derivation of ground-state female ES cells maintaining gamete-derived DNA methylation[J]. Nature, 2017. IF=41.577
2017 年?yáng)|京大學(xué)在 Nature 主刊雜志上發(fā)表了有關(guān)胚胎模型研究的文章。研究使用 Mek1/2 /Gsk3β 抑制劑(2i)和白血病抑制因子(L)處理胚胎干細(xì)胞(ES 細(xì)胞)后,發(fā)現(xiàn)會(huì)出現(xiàn)廣泛的 DNA 甲基化缺失和胎盤發(fā)育受損,但是早期(P3)雌性 2i/L ES 細(xì)胞以回復(fù)配子中的 DNA 甲基化狀態(tài)并具有分化發(fā)育潛能。早期雌性 2i/L ES 細(xì)胞可能成為研究胚胎早期發(fā)育的新平臺(tái)。
重點(diǎn)產(chǎn)品三:重磅推出 DNA 羥甲基化檢測(cè)(4000¥/ 樣本)
5hmC,作為 5 - 甲基胞嘧啶(5mC)的氧化產(chǎn)物,是 DNA 甲基化修飾動(dòng)態(tài)調(diào)控過程重要的中間產(chǎn)物。5hmC 主要富集在基因的轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn),轉(zhuǎn)錄終止位點(diǎn)和基因遠(yuǎn)端區(qū)域的上游和下游。已有研究報(bào)道 5hmC 與癌癥、神經(jīng)退行性疾病等有關(guān)。2017 年,《Cell Research》上連續(xù)發(fā)表了兩篇使用芝加哥大學(xué)何川教授設(shè)計(jì)并優(yōu)化的 5hmC 富集測(cè)序技術(shù),驗(yàn)證 5hmC 在腫瘤臨床應(yīng)用的文章。
針對(duì) gDNA,組織和細(xì)胞樣本,技術(shù)方法經(jīng)歷 10000+ 例樣本洗禮。
活動(dòng)說明
2019 年 3 月 11 日 - 5 月 11 日期間,前 200 個(gè)樣本可享受優(yōu)惠的促銷價(jià)格,同時(shí)還可贈(zèng)送高級(jí)分析(任選三項(xiàng),需滿足單項(xiàng)分析限定的樣本需求,10 個(gè)樣本以內(nèi))。
伯豪優(yōu)勢(shì)
上海伯豪生物本次推出的 5 - 羥甲基化檢測(cè)服務(wù)技術(shù)與何川教授發(fā)表在 Nature Biotechnology 上的技術(shù)一致。目前為止,該技術(shù)已經(jīng)在 10000+ 例樣本上得到了應(yīng)用。
技術(shù)文獻(xiàn)應(yīng)用
1. Selective chemical labeling reveals the genome-wide distribution of 5-hydroxymethylcytosine. Nature Biotechnology. IF=35.724
2. A Highly Sensitive and Robust Method for Genome wide 5hmC Profiling of Rare Cell Populations. Molecular Cell. IF=14.2
3. 5-Hydroxymethylcytosine signatures in circulating cell-free DNA as diagnostic biomarkers for human cancers. Cell Research. IF=15.4
4. Circulating tumor DNA 5-hydroxymethylcytosine as a novel diagnostic biomarker for esophageal cancer. Cell Research. IF=15.4
樣本要求
1、樣品類型:
gDNA,組織,細(xì)胞;
2、樣品純度:
OD 260/280 值應(yīng)在 1.8~2.0 之間;RNA 應(yīng)去除干凈;
3、 樣品濃度:
使用 Qubit 準(zhǔn)確定量 DNA 濃度;
4、樣品總量:
每個(gè)樣品 DNA 起始總量不少于 1ug。
測(cè)序策略
1、數(shù)據(jù)量:15M reads/ 樣本
2、 測(cè)序方法:PE 38
參與方式
電話報(bào)名:400-880-5086(工作日:早 8 點(diǎn)至晚 17 點(diǎn));
活動(dòng)開始:2019 年 03 月 11 日 0:00(開始)
活動(dòng)截止:2019 年 05 月 11 日 0:00(結(jié)束)
活動(dòng)說明: 前 200 張芯片可享受優(yōu)惠的促銷價(jià)格,同時(shí)還可贈(zèng)送高級(jí)分析(任選三項(xiàng),需滿足單項(xiàng)分析限定的樣本需求,20 個(gè)樣本以內(nèi))。
活動(dòng)單位: 上海伯豪生物技術(shù)有限公司
活動(dòng)聲明: 本活動(dòng)解釋權(quán)歸上海伯豪生物技術(shù)有限公司所有。