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單細(xì)胞核 RNA 測(cè)序(snRNA-seq)優(yōu)勢(shì)
1、冷凍組織可以用于直接抽提細(xì)胞核,為臨床回顧性研究中單細(xì)胞測(cè)序的開展提供了解決方案。
2、有些組織通過酶解消化很難拿到高質(zhì)量的細(xì)胞懸液,通過抽提細(xì)胞核,避開酶解消化,是一個(gè)更好的選擇。
3、適用于對(duì)解離酶敏感(如神經(jīng)元、肝實(shí)質(zhì)細(xì)胞)、直徑較大、形狀不規(guī)則(如心肌細(xì)胞)等特殊細(xì)胞類型。
4、直接從組織抽提細(xì)胞核,不需要酶解消化及恒溫孵育,避免了組織解離過程中誘導(dǎo)應(yīng)激基因的表達(dá)。
伯豪生物豐富的單細(xì)胞核抽提經(jīng)驗(yàn)
利用自主研發(fā)的“伯優(yōu) ? 細(xì)胞核分離試劑盒”已經(jīng)完成大腦皮層、下丘腦、海馬、延髓、松果體、肝臟、心臟、膠質(zhì)瘤、骨、乳腺和胰腺等 20 多種組織的抽核制備及上機(jī)測(cè)序。
送樣要求
1、組織用量:黃豆粒大小 1 塊;
2、樣本處理:組織液氮速凍,-80℃保存;
3、質(zhì)量要求:組織 RNA 無降解,RIN≥7;
4、運(yùn)輸方式:干冰運(yùn)輸。
結(jié)果展示
1、腦組織
腦組織 snRNA-seq 各種細(xì)胞類型比例:神經(jīng)元(Neurons)73.0%;星形膠質(zhì)細(xì)胞(Astrocytes)9.4%;少突膠質(zhì)細(xì)胞(Oligodendrocytes)9.2%;內(nèi)皮細(xì)胞(Endothelial cells)6.7%;小膠質(zhì)細(xì)胞(Microglial cells)1.4% 及嗅鞘膠質(zhì)細(xì)胞(Olfactory ensheathing glia)0.4%。
2、心臟組織
心臟組織 snRNA-seq 各種細(xì)胞類型比例:心肌細(xì)胞(Cardiomyocytes)38.8%;內(nèi)皮細(xì)胞(Endothelial cells)30.3%;成纖維細(xì)胞(Fibroblasts)16.6;神經(jīng)元細(xì)胞(Neuronal cells)6.3%;巨噬細(xì)胞(Macrophages)6.0%;Monoblasts 0.8%;間皮細(xì)胞(Mesothelial cells)0.6%;T 和 B 細(xì)胞分別占 0.4%;中性粒細(xì)胞(Neutrophil cells)0.4%;脂肪細(xì)胞(Adipocytes)0.2% 及髓細(xì)胞(Myeloid cells)0.1%。
3、肝臟組織
肝臟組織 snRNA-seq 各種細(xì)胞類型比例:肝細(xì)胞(Hepatocytes)56.0%;內(nèi)皮細(xì)胞(Endothelial cells)10.9%;膽管細(xì)胞(Cholangiocytes)9.4%;成纖維細(xì)胞(Fibroblasts)9.2%;星狀細(xì)胞(Stellate cells)8.7%;T 細(xì)胞 4.7% 及 B 細(xì)胞 1.1%。
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