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伯豪生物
龍行龘龘 |935K 甲基化芯片福利來襲
發(fā)布時間:2024-02-21 瀏覽次數(shù):4819
服務(wù)科技創(chuàng)新,護(hù)航人類健康!www.dlqkx.org.cn

935K 甲基化芯片(Infinium Methylation EPIC v2.0 BeadChip)是一種全基因組甲基化篩選工具,靶向人類甲基化組最具生物學(xué)意義的區(qū)域中超過 935,000 個 CpG 位點,同時在其前代產(chǎn)品 Methylation EPIC v1.0(850K)的基礎(chǔ)上極大的提高了向后兼容性。該芯片保留了以單核苷酸分辨率定量分析全基因組 CpG 的能力,同時提供高度準(zhǔn)確和精確的甲基化測量,不受測序深度的影響??墒褂镁啞⒂脩粲押玫?Infinium 甲基化檢測分析多種 DNA 樣本類型,包括從 FFPE 分離的 DNA 樣本。與其他方法相比,Methylation EPIC v2.0 具有可擴(kuò)展性和更低的單個樣本總成本,因此可用于探究疾病機(jī)制和生物標(biāo)志物的篩選。


活動福利

滿  50 個樣本   送 好禮   

滿  100 個樣本   更有   豪禮加送


項目周期: 自 DNA 質(zhì)控合格后標(biāo)準(zhǔn)生信分析結(jié)果發(fā)送 10 個工作日;

交付結(jié)果: 標(biāo)準(zhǔn)生信分析報告和原始數(shù)據(jù);

DNA 要求: 常規(guī) DNA 總量≥1ug,濃度≥50ng/μl,OD260/280 在 1.8 左右;不得有其它個體或其它物種的 DNA 或 RNA 污染;溶解在 H20 或 TE (pH 8.0),特殊樣本視具體情況實驗。

活動時間:2024 年 2 月 18 日至 2024 年 5 月 31 日

活動說明:

1、合同雙方簽訂完成時間必須在活動時間內(nèi);

2、單次送樣數(shù)目為 8 的倍數(shù);

3、活動最終解釋權(quán)歸伯豪生物所有。


935K 芯片優(yōu)勢

  • 全面的基因組覆蓋范圍: 檢測 > 935,000 個 CpG 位點,全面覆蓋 CpG 島、啟動子、編碼區(qū)及增強(qiáng)子。

  • 探針位點的全面優(yōu)化: 在 EPICv1.0-850K 的基礎(chǔ)上去除了性能不佳的探針,新增 186,000 個 CpG 靶向增強(qiáng)子和超級增強(qiáng)子、更多 CTCF 結(jié)合位點、CNV 檢測區(qū)域、EPIC v1.0 覆蓋不足的 CpG 島以及常見癌癥驅(qū)動突變。

  • 兼容多種樣本類型: 包括 FFPE、新鮮 / 冷凍組織、全血、口腔細(xì)胞、cfDNA、唾液和其他樣本類型。

  • 高質(zhì)量的數(shù)據(jù): 沿用了 450K 芯片的 Infinium 技術(shù),同時采用 Infinium I 及 II 探針設(shè)計,使檢測范圍最大化。

  • 分辨率高: 單堿基分辨率,可以直接檢測到發(fā)生甲基化的準(zhǔn)確位點。

  • 可重復(fù)性高: 自身技術(shù)重復(fù)間的相關(guān)性以及與 850K 相同探針間的相關(guān)性 R2>0.99。

  • 注釋信息: 人參考基因組版本更新到 hg38,GenCode 數(shù)據(jù)庫更新到 v41 版本。


  • 935K 與 850K 芯片數(shù)據(jù)相關(guān)性

    935K 甲基化芯片檢測能夠檢測到 0.2 的 beta 值差異,假陽性率低于 1%,從而實現(xiàn)了較高的分析靈敏度,同時也具有極好的數(shù)據(jù)可重現(xiàn)性。

    如下圖:

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    (A)935K 芯片技術(shù)重復(fù)相關(guān)性 R 2>0.99;

    (B)935K 芯片和 850K 的交集探針間的相關(guān)性 R 2>0.99;

    (C)935K 芯片數(shù)據(jù)與甲基化測序(100X 測序深度)的相關(guān)性 R 2>96%。


    935K 芯片實測數(shù)據(jù)展示

    嚴(yán)格按照 Illumina Infinium MethylationEPIC v2.0 BeadChip(簡稱 935K)操作手冊完成 DNA 抽提、轉(zhuǎn)化、擴(kuò)增、雜交洗脫等,質(zhì)控結(jié)果說明雜交實驗過程穩(wěn)定、轉(zhuǎn)化率高、熒光信號和結(jié)合狀況良好,綜合說明實驗操作穩(wěn)定,可以進(jìn)一步做甲基化的數(shù)據(jù)分析。

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