近年來,非編碼 RNA(ncRNA)調(diào)控一直是生物學(xué)研究,特別是疾病研究的熱點;包括 miRNA、rRNA、tRNA、lncRNA 和 circRNA 等多種未知功能的 RNA。大部分的環(huán)狀 RNA 是由外顯子序列構(gòu)成,在不同的物種中具有保守性,同時存在組織及不同發(fā)育階段的表達(dá)特異性。由于 circRNA 對核酸酶不敏感,所以比線性 RNA 更為穩(wěn)定,這使得 circRNA 在作為新型臨床診斷標(biāo)記物的開發(fā)應(yīng)用上具有明顯優(yōu)勢,今天就與大家分享幾篇 circRNA 領(lǐng)域的近期研究。
文章展示
環(huán)狀 RNA-ZNF532 調(diào)節(jié)糖尿病引起的視網(wǎng)膜周細(xì)胞變性和血管功能障礙
Circular RNA-ZNF532 regulates diabetes-induced retinal pericyte degeneration and vascular dysfunction
期刊:J Clin Invest
影響因子:12.282
單位: 復(fù)旦大學(xué)、南京醫(yī)科大學(xué)
摘要: 糖尿病視網(wǎng)膜?。―R)是工作年齡成人視力喪失的主要原因。血管周細(xì)胞變性是 DR 的主要臨床表現(xiàn),但對周細(xì)胞變性的機制了解甚少。環(huán)狀 RNA(circRNA)在多種生物學(xué)過程和疾病進(jìn)展中起重要作用。該研究中,研究者調(diào)查了 circRNA 在周細(xì)胞生物學(xué)和糖尿病引起的視網(wǎng)膜血管功能障礙中的作用。在糖尿病應(yīng)激下的周細(xì)胞中,糖尿病鼠模型的視網(wǎng)膜血管中以及糖尿病患者的玻璃體液中,cZNF532 的表達(dá)上調(diào)。cZNF532 沉默可降低周細(xì)胞的活力,增殖和分化,并抑制周細(xì)胞向內(nèi)皮細(xì)胞募集。cZNF532 通過充當(dāng) miR-29a-3p 海綿并誘導(dǎo) NG2,LOXL2 和 CDK2 的表達(dá)增加,進(jìn)而調(diào)節(jié)周細(xì)胞生物學(xué)功能。降低 cZNF532 或 miR-29a-3p 的表達(dá)加劇了鏈脲佐菌素誘導(dǎo)的視網(wǎng)膜周細(xì)胞變性和血管功能障礙。相比之下,cZNF532 的過表達(dá)或 miR-29a-3p 的抑制可改善人糖尿病性視網(wǎng)膜病變引起的玻璃體和視網(wǎng)膜周細(xì)胞變性和血管功能障礙。該研究結(jié)果數(shù)據(jù)確定了 circRNA 介導(dǎo)的機制,可協(xié)調(diào) DR 中的周細(xì)胞生物學(xué)和血管穩(wěn)態(tài)。誘導(dǎo) cZNF532 或抑制 miR-29a-3p 是治療 DR 的一種可利用的治療方法。
圖示:cZNF532 在糖尿病視網(wǎng)膜?。―R)中功能機制示意圖
環(huán)狀 RNA-circBFAR 通過 miR-34b-5p/MET/Akt 通路促進(jìn)胰腺導(dǎo)管腺癌的惡化
Circular RNA circBFAR promotes the progression of pancreatic ductal adenocarcinoma via the miR-34b-5p/MET/Akt axis
期刊:Molecular Cancer
影響因子:10.679
單位: 中山大學(xué)孫逸仙紀(jì)念醫(yī)院
摘要: 眾多的研究表明,CircRNA 是癌癥惡化的重要參與者,目前胰腺導(dǎo)管腺癌(PDAC) 中 CircRNA 的生物學(xué)過程和潛在機制尚不清楚。此研究中研究者通過 Sanger 測序驗證 CircRNA,采用菌落形成、5-Ethynyl-2‘- 脫氧尿苷(EDU) 和 Transwell 法研究了 CIRCB FAR 對 PDAC 細(xì)胞體外增殖、侵襲和轉(zhuǎn)移的影響。進(jìn)行 RNA pull-down 測定以驗證 circBFAR 與 microRNA miR-34b-5p 的結(jié)合。在研究中,發(fā)現(xiàn)了一種新的 CircRNA(circBFAR,hsa_circ_0009065),在 208 例 PDAC 患者隊列中上調(diào)。circBFAR 的異位表達(dá)與腫瘤淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移(TNM)呈正相關(guān),并且與 PDAC 患者的預(yù)后較相關(guān)性較差。此外,抑制 circBFAR 表達(dá)顯著抑制體外 PDAC 細(xì)胞的增殖和運動及其腫瘤促進(jìn)和體內(nèi)模型中的轉(zhuǎn)移特性。從機制上講,circBFAR 還通過使 miR-34b-5p 海綿化而上調(diào)了間充質(zhì)上皮轉(zhuǎn)化因子(MET)的表達(dá);circBFAR 過表達(dá)增加了 MET 的表達(dá)并激活了 Akt 的下游磷酸化(Ser 473),進(jìn)一步激活了 MET / PI3K / Akt 信號傳導(dǎo)途徑,促進(jìn)了 PDAC 細(xì)胞的惡化。重要的是,MET 抑制劑的應(yīng)用可以顯著減弱體內(nèi) circBFAR 介導(dǎo)的腫瘤發(fā)生。文章的研究結(jié)果表明,circBFAR 在 PDAC 的增殖和轉(zhuǎn)移中起著重要作用,可將其作為 PDAC 的潛在預(yù)后標(biāo)志物和治療靶點進(jìn)行探索。
圖示:circBFAR 通過 miR-34b-5p/MET 通路促進(jìn) PDAC 增殖和轉(zhuǎn)移 的提示機制
TDCIPP 暴露引起的 PC12 細(xì)胞 circRNA 表達(dá)譜的變化可能通過 Traf2 基因調(diào)節(jié)下游的 NF-κB 通路
Changes in the circRNA expression profile of PC12 cells induced by TDCIPP exposure may regulate the downstream NF-κB pathway via the Traf2 gene
期刊:Chemosphere
影響因子:5.108
單位: 天津醫(yī)科大學(xué)
摘要: 磷酸三酯(1,3- 二氯 -2- 丙基)作為一種常用的有機磷阻燃劑(OPFR),已成為一種環(huán)境污染物。研究表明,TDCIPP 暴露具有許多毒性作用,如神經(jīng)毒性,生殖發(fā)育毒性和內(nèi)分泌紊亂。CircRNA 是環(huán)狀非編碼 RNA,已發(fā)現(xiàn)它們在多種疾病的發(fā)生中起重要作用。但是,尚不清楚 circRNA 是否在 TDCIPP 暴露誘導(dǎo)的細(xì)胞毒性中起作用。在此研究中,研究者分析了對照組和 PC12 細(xì)胞的 TDCIPP 暴露組的 circRNA 芯片結(jié)果,并檢測到 3432 個差異表達(dá)的 circRNA(P<0.05),其中 TDCIPP 暴露組中 1682 個上調(diào),1750 個下調(diào)。通過 qRT-PCR 驗證 2 個上調(diào)的和 3 個下調(diào)的 circRNA 的表達(dá)水平,結(jié)果與芯片結(jié)果一致。然后,對幾種 circRNA 進(jìn)行 ceRNA 分析以預(yù)測可能的結(jié)合 miRNA 和結(jié)合位點。通過京都基因和基因組百科全書(KEGG)途徑分析分析靶基因。通過預(yù)測分析,發(fā)現(xiàn) rno_circRNA_013845,rno-miR-361-3p 和 rno-miR-702-3p 可能參與 Traf2 表達(dá)的調(diào)節(jié),從而影響下游 NF-kB 信號通路的表達(dá)并引起細(xì)胞凋亡。
研究思路
上面這篇文章使用的就是研究 circRNA 芯片常使用的一套研究思路:

技術(shù)路線圖
可能很多人想問為何相似的研究套路也可以發(fā)高分的文章呢?就像開頭所說,circRNA 可謂是熱點中的熱點,是目前生物學(xué)研究領(lǐng)域的流量擔(dān)當(dāng),加上高端技術(shù)的加持,課題新穎,自然容易得到關(guān)注,高分文章也不在話下啦~
研究利器
Shbio ceRNA 芯片自推出以來,助力伯豪客戶發(fā)表了多篇高分文章。來自天津平津醫(yī)院的研究團隊借助 Shbio human ceRNA 芯片 V1.0 篩選膠質(zhì)母細(xì)胞瘤(GBM)中特異高表達(dá)的 circRNA/lncRNA,通過進(jìn)一步的分子機制及功能研究發(fā)現(xiàn) circNT5E 能夠作為 miRNA-422a 的海綿吸附體,抑制其活性,進(jìn)而影響膠質(zhì)母細(xì)胞瘤的腫瘤發(fā)生。來自天津的另一研究團隊利用 Shbio human ceRNA 芯片 V1.0 檢測胃癌病人血漿外泌體中關(guān)鍵的 circRNA,通過一系列的研究發(fā)現(xiàn)外泌體中的 circRNA ciRS-133 可以通過靶向 miR-133/PRDM16 途徑促進(jìn)白色脂肪褐變。
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