從 IPA 的 function 富集結(jié)果中不僅可以看到 function 的富集顯著性,并且可以得到 function 的激活抑制的信息。
IPA—Diseases and Bio Functions 介紹
此分析通過 IPA 的 Ingenuity Knowledge Base 數(shù)據(jù)庫,進(jìn)行 Fisher 高精度檢驗(yàn)得到具有顯著性意義的 Diseases 和 Bio Functions(Bio Functions 類似 GO),從而可以得到特定實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)的生物的趨勢(shì),并且預(yù)測(cè)基因表達(dá)的改變對(duì)生物過程的影響,比如說是減少還是增強(qiáng)。
1、差異 mRNA 或者關(guān)注的 mRNA 基因集;
2、物種限于人,大鼠,小鼠;
3、每個(gè)基因有對(duì)應(yīng)的差異倍數(shù)。
1、圖片格式:function 分類柱狀圖;
2、文本格式:function 的富集結(jié)果。
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