DNBelab?C 系列高通量單細(xì)胞 RNA 文庫制備試劑盒套裝 V3.0 在原版本基礎(chǔ)上完成了全新升級(jí)，包括液滴生成儀器 TaiM4，加樣載片，液滴生成試劑，高通量文庫制備試劑和開源的數(shù)據(jù)質(zhì)控分析包來支持全流程的單細(xì)胞測(cè)序分析。
雙磁珠捕獲系統(tǒng)：mRNA 捕獲磁珠與液滴識(shí)別微珠，提高捕獲效率。
DNBelab C4 平臺(tái)是基于微流控技術(shù)原理，通過雙磁珠系統(tǒng)（大磁珠捕獲 mRNA，小磁珠識(shí)別大磁珠）精準(zhǔn)識(shí)別磁珠多胞、增加捕獲效率。大磁珠捕獲 mRNA 和小磁珠釋放的 Oligo 之后的結(jié)構(gòu)如圖所示，之后 cDNA 的 Oligo 會(huì)分開建庫測(cè)序，Cell barcode 和 Oligo index 建立 reads- 磁珠 - 細(xì)胞的映射關(guān)系。
DNBelab C-TaiM 4 單細(xì)胞液滴生成儀；
DNBelab C-TaiM 4 單細(xì)胞液滴生成儀，配備 4 個(gè)獨(dú)立控制的微流控通路，同時(shí)兼容單細(xì)胞 3'RNA 文庫和 ATAC 文庫制備，支持 1~4 樣本靈活上樣，小巧輕便、即開即用，適用于 2.5 千米以下海拔的實(shí)驗(yàn)室環(huán)境。
1、平臺(tái)互補(bǔ)：與 10X Genomics 等平臺(tái)的互補(bǔ)，客戶靈活自選。
2、覆蓋度高：測(cè)序覆蓋 cDNA 的全長序列，每個(gè)細(xì)胞能夠獲得上萬個(gè)基因的表達(dá)。
3、信息個(gè)性化：除了獲得基因表達(dá)信息，數(shù)據(jù)能夠用于可變剪接，cSNP 等分析，以及帶 poly- A 結(jié)構(gòu)的 lncRNA 研究。
DNBelab C 系列高通量單細(xì)胞 RNA 文庫制備試劑盒開展的研究或應(yīng)用涵蓋的樣本類型豐富，包括人、鼠等 動(dòng)物和擬南芥、水稻等植物超過 50 個(gè)物種的 300 多個(gè)組織類型。
DNBelab C 系列高通量單細(xì)胞 RNA 測(cè)序
根據(jù)實(shí)驗(yàn)經(jīng)驗(yàn)表明，人的 PBMC 細(xì)胞、腦細(xì)胞核、脂肪細(xì)胞核、鼠肺癌細(xì)胞等樣本類型的細(xì)胞捕獲效率 >50%，基因檢出均達(dá)到 1000 多。
此外，實(shí)驗(yàn)經(jīng)驗(yàn)證實(shí)，DNBelab C 系列高通量單細(xì)胞 RNA 文庫制備試劑盒套裝性能非常穩(wěn)定，平行樣本實(shí) 驗(yàn)結(jié)果具有很高的一致性。
DNBelab C 系列高通量單細(xì)胞 RNA 測(cè)序已廣泛應(yīng)用于科學(xué)研究和臨床應(yīng)用，尤其是在腫瘤、微生物、神經(jīng)科學(xué)、免疫學(xué)等領(lǐng)域均有高分文章發(fā)表。
| ? 腫瘤 | 微生物 ? | 神經(jīng)科學(xué) ? | 免疫學(xué) ? | ? 其它 |
? 截止 2024 年 5 月，利用 DNBelab C 系列高通量單細(xì)胞 RNA 測(cè)序技術(shù)進(jìn)行研究發(fā)表的文章累計(jì) 80 多篇，尤其是在 Nature，Cell，Cell Research，Immunity 等國際頂刊也發(fā)表過多篇代表性文章。
文獻(xiàn)案例 1：獼猴全身器官細(xì)胞圖譜
文章標(biāo)題：Cell transcriptomic atlas of the non-human primate Macaca fascicularis
發(fā)表期刊：Nature?
影響因子：64.8?
發(fā)表時(shí)間：2022.04?
樣本信息： 獼猴全身 45 種器官或組織 ?
研究摘要： 利用 DNBelab-C4 和 DNBSEO 測(cè)序平臺(tái)，對(duì)食蟹猴的主要組織器官（肺、腎臟、肝、胰腺、大腦、主動(dòng)脈、甲狀腺、腮腺和血液）進(jìn)行單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序，建立了食蟹猴單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)庫，鑒定出 44 種 食蟹猴的主要細(xì)胞類型，在國際上首次完成構(gòu)建非人靈長類單細(xì)胞圖 V1.0，對(duì)于新冠藥物和疫苗的研發(fā)具有重要指導(dǎo)作用。
文獻(xiàn)案例 2：體外誘導(dǎo)獲得人類全能干細(xì)胞
文章標(biāo)題：Rolling back human pluripotent stem cells to an eight-cell embryo-like stage?
發(fā)表期刊：Nature?
影響因子：64.8?
發(fā)表時(shí)間：2022.03?
樣本信息： 人類 8C 期胚胎樣細(xì)胞（8CLC)?
研究摘要： 該研究利用 DNBelab-C4 和 DNBSEQ 測(cè)序平臺(tái)，對(duì) 8CLC 誘導(dǎo)過程的細(xì)胞樣本進(jìn)行了單細(xì)胞 轉(zhuǎn)錄組（scRNA-seq）和染色質(zhì)可及性（scATAC-seq）測(cè)序，詳細(xì)分析了 8CLC 群體的特征，并在多個(gè)誘導(dǎo) 時(shí)間點(diǎn)描繪了 8CLC 誘導(dǎo)過過程中轉(zhuǎn)錄組和染色質(zhì)開放性的動(dòng)態(tài)變化，為研究人類 8 細(xì)胞期的合子基因 組激活和發(fā)育調(diào)控提供了重要的平臺(tái)和資源。
文獻(xiàn)案例 3：最詳盡的人類骨骼肌衰老大細(xì)胞圖譜
文章標(biāo)題：Multimodal cell atlas of the ageing human skeletal muscle?
發(fā)表期刊：Nature?
影響因子：64.8?
發(fā)表時(shí)間：2024.05?
樣本信息： 來著不同性別，不同年齡的 31 個(gè)人下肢肌肉骨骼肌 研究摘要：該研究利用單細(xì)胞核轉(zhuǎn)錄組、單細(xì)胞核染色質(zhì)開放組技術(shù)，結(jié)合組織染色，構(gòu)建了包含 31 個(gè) 人（包括 17 名男性和 14 名女性，覆蓋 15-99 歲的人群）下肢肌肉骨骼肌多模態(tài)單細(xì)胞圖譜。通過對(duì) 387000 多個(gè)細(xì)胞 / 核的深入分析，研究人員詳細(xì)描述了細(xì)胞群體在衰老過程中的變化，包括老年人群 新出現(xiàn)的細(xì)胞群體，以及這些變化背后的細(xì)胞特異性特征和多細(xì)胞間的網(wǎng)絡(luò)互動(dòng)特性。該研究在轉(zhuǎn)錄 組學(xué)和表觀遺傳學(xué)層面上深入探討了與骨骼肌衰老相關(guān)的分子機(jī)制。
