
伯豪生物每月匯總單細(xì)胞文章,希望對各位老師的關(guān)注或研究有幫助!4月份單細(xì)胞測序相關(guān)文獻(xiàn)共收錄36篇(IF>9),我們選取其中5篇與大家分享,并在文末附表中列出文獻(xiàn)發(fā)表期刊、研究方向和技術(shù)平臺等信息。重要!不用再費時搜索,也不用費力下載,輕松了解單細(xì)胞文章信息,文末可領(lǐng)取4月單細(xì)胞文章合集!
高通量測序技術(shù)的發(fā)展為人類疾病機(jī)制研究、遺傳病診斷、產(chǎn)前篩查與診斷、腫瘤診斷與治療等帶來了新的應(yīng)用機(jī)遇。全外顯子組測序,是利用序列捕獲技術(shù)將全基因組外顯子區(qū)域的DNA捕捉并富集后,進(jìn)行高通量測序的基因組分析方法。
【“小海膽”邀您看高分文章】BD 靶向單細(xì)胞多組學(xué)在低測序深度下實現(xiàn)蛋白和低豐度轉(zhuǎn)錄組同時檢測
上一回,我們著重講述了為何要進(jìn)行蛋白檢測。其中幾個關(guān)鍵參數(shù)大家一定記住了吧!比如在全基因組中,mRNA和蛋白質(zhì)表達(dá)水平之間的相關(guān)性很差,在許多研究中的解釋力(explanatory power)徘徊在40%左右。這一回,我們來講述如何進(jìn)行蛋白質(zhì)檢測。
之前我們略述了代謝組學(xué)的課題設(shè)計,按照設(shè)計的思路進(jìn)行實驗后,就需要進(jìn)行代謝樣本的收集了。今天咱按照不同類型的樣本,給大家提供一點收集的建議。
在有限的細(xì)胞核空間中,基因組的大部分是緊密折疊的,僅留下需要轉(zhuǎn)錄的部分是開放的。打開的染色質(zhì),就允許一些調(diào)控蛋白(比如轉(zhuǎn)錄因子和輔因子)跑過來與之相結(jié)合。而染色質(zhì)的這種特性,就叫做染色質(zhì)的可及性(chromatin accessibility)。ATAC-seq是利用高通量測序檢測轉(zhuǎn)座酶易接近的染色質(zhì)的技術(shù)。 ATAC-seq只需要很少的細(xì)胞就能鑒定基因組中所有活躍的調(diào)控序列。
DNA甲基化(DNA methylation)是目前研究得清楚、也是重要的表觀遺傳修飾形式,主要是基因組DNA上的胞嘧啶第5位碳原子和甲基間的共價結(jié)合,胞嘧啶由此被修飾為5甲基胞嘧啶(5-methylcytosine,5mC)。別看這只是一個小小的改變,它所起到的作用卻是巨大的!有些科學(xué)家甚至將DNA甲基化叫做“第五種堿基”!
伯豪生物目前已經(jīng)先后建成DNA甲基化檢測芯片/二代測序平臺、RNA甲基化分析平臺,組蛋白修飾分析平臺、轉(zhuǎn)錄因子分析平臺和開放染色質(zhì)分析服務(wù)平臺。2012年至今,伯豪生物表觀產(chǎn)品線已經(jīng)累計為客戶完成約1000例以上科研服務(wù)項目,涉及組織、細(xì)胞、全血、FFPE等各類實驗樣本約2萬例以上,涵蓋腫瘤、胚胎發(fā)育、復(fù)雜疾病等各個領(lǐng)域,協(xié)助客戶在J Clin Oncol、Nat Commun、PNAS、Ann Rheum Dis等高水平期刊發(fā)表論文30余篇,累計影響因子150以上(累計到2020年3月)。下面讓我們一起來欣賞下部分高分文章吧。
華大 DNBelab C 系列 | 一個非常規(guī)的七鰓鰻淋巴細(xì)胞譜系的發(fā)現(xiàn)突出了脊椎動物適應(yīng)性免疫系統(tǒng)進(jìn)化的不同特征
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技術(shù)突破 | FFPE 樣本產(chǎn)出高質(zhì)量單細(xì)胞數(shù)據(jù)的秘籍
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